MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 2828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013210	C	6	6	168639	168644	0 %	0 %	0 %	100 %	258513070
2502	NC_013210	TGGT	2	8	168664	168671	0 %	50 %	50 %	0 %	258513070
2503	NC_013210	GCCA	2	8	168736	168743	25 %	0 %	25 %	50 %	258513070
2504	NC_013210	AC	3	6	168796	168801	50 %	0 %	0 %	50 %	258513070
2505	NC_013210	CGA	2	6	168836	168841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513070
2506	NC_013210	TG	3	6	169011	169016	0 %	50 %	50 %	0 %	258513070
2507	NC_013210	CCGC	2	8	169027	169034	0 %	0 %	25 %	75 %	258513070
2508	NC_013210	CAC	2	6	169035	169040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513070
2509	NC_013210	TG	3	6	169083	169088	0 %	50 %	50 %	0 %	258513070
2510	NC_013210	CCG	2	6	169342	169347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513070
2511	NC_013210	GAT	2	6	169353	169358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513070
2512	NC_013210	T	6	6	169370	169375	0 %	100 %	0 %	0 %	258513070
2513	NC_013210	TGC	2	6	169726	169731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2514	NC_013210	TGC	2	6	169734	169739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2515	NC_013210	CGG	2	6	169792	169797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513071
2516	NC_013210	CAC	2	6	169894	169899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2517	NC_013210	GGT	2	6	169933	169938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513071
2518	NC_013210	CAC	3	9	169947	169955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2519	NC_013210	GGAT	2	8	170010	170017	25 %	25 %	50 %	0 %	258513071
2520	NC_013210	CAG	2	6	170151	170156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2521	NC_013210	CGA	2	6	170200	170205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2522	NC_013210	GCT	2	6	170246	170251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2523	NC_013210	GGCA	2	8	170286	170293	25 %	0 %	50 %	25 %	258513071
2524	NC_013210	GAT	2	6	170294	170299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513071
2525	NC_013210	GCC	3	9	170443	170451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513071
2526	NC_013210	CG	3	6	170470	170475	0 %	0 %	50 %	50 %	258513071
2527	NC_013210	TGG	2	6	170506	170511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513071
2528	NC_013210	GCA	2	6	170591	170596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2529	NC_013210	ACG	2	6	170640	170645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2530	NC_013210	CCA	2	6	170648	170653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2531	NC_013210	GAA	2	6	170715	170720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513071
2532	NC_013210	CGT	2	6	170756	170761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2533	NC_013210	CA	3	6	170771	170776	50 %	0 %	0 %	50 %	258513071
2534	NC_013210	CAC	2	6	170802	170807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2535	NC_013210	GCC	2	6	170808	170813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513071
2536	NC_013210	TGAG	2	8	170872	170879	25 %	25 %	50 %	0 %	258513072
2537	NC_013210	TTTC	2	8	170902	170909	0 %	75 %	0 %	25 %	258513072
2538	NC_013210	CAG	2	6	171029	171034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
2539	NC_013210	CAGC	2	8	171059	171066	25 %	0 %	25 %	50 %	258513072
2540	NC_013210	CAG	2	6	171158	171163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
2541	NC_013210	GCA	2	6	171186	171191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
2542	NC_013210	GT	3	6	171435	171440	0 %	50 %	50 %	0 %	258513072
2543	NC_013210	CCA	2	6	171441	171446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513072
2544	NC_013210	GCC	2	6	171504	171509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513072
2545	NC_013210	CCA	2	6	171535	171540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513072
2546	NC_013210	GCC	2	6	171554	171559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513072
2547	NC_013210	CGC	2	6	171592	171597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513072
2548	NC_013210	CAG	2	6	171656	171661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
2549	NC_013210	GCCATC	2	12	171668	171679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258513072
2550	NC_013210	AG	3	6	171771	171776	50 %	0 %	50 %	0 %	258513072
2551	NC_013210	GTG	2	6	171804	171809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513072
2552	NC_013210	CAT	2	6	171821	171826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513072
2553	NC_013210	GCA	2	6	171855	171860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513073
2554	NC_013210	GAA	2	6	171973	171978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513073
2555	NC_013210	CA	3	6	172121	172126	50 %	0 %	0 %	50 %	258513073
2556	NC_013210	TCCGG	2	10	172164	172173	0 %	20 %	40 %	40 %	258513073
2557	NC_013210	GCA	2	6	172186	172191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513073
2558	NC_013210	GGC	2	6	172192	172197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513073
2559	NC_013210	ATG	2	6	172199	172204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513073
2560	NC_013210	TCA	2	6	172217	172222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513073
2561	NC_013210	TCGCG	2	10	172224	172233	0 %	20 %	40 %	40 %	258513073
2562	NC_013210	CGG	2	6	172277	172282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513073
2563	NC_013210	ACA	2	6	172328	172333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513073
2564	NC_013210	CCCGG	2	10	172431	172440	0 %	0 %	40 %	60 %	258513074
2565	NC_013210	CAC	2	6	172566	172571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513074
2566	NC_013210	TCT	2	6	172748	172753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513074
2567	NC_013210	CTGC	2	8	172760	172767	0 %	25 %	25 %	50 %	258513074
2568	NC_013210	GGC	2	6	172770	172775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513074
2569	NC_013210	GGC	2	6	172843	172848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513074
2570	NC_013210	CCG	2	6	172877	172882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513074
2571	NC_013210	GCA	2	6	172915	172920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2572	NC_013210	GTC	2	6	172948	172953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2573	NC_013210	CAG	2	6	172985	172990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2574	NC_013210	GTCCG	2	10	173035	173044	0 %	20 %	40 %	40 %	258513074
2575	NC_013210	GCCC	2	8	173236	173243	0 %	0 %	25 %	75 %	258513074
2576	NC_013210	AGC	2	6	173251	173256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2577	NC_013210	TGC	2	6	173302	173307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2578	NC_013210	GC	3	6	173306	173311	0 %	0 %	50 %	50 %	258513074
2579	NC_013210	GCC	2	6	173400	173405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513074
2580	NC_013210	GCC	2	6	173560	173565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513075
2581	NC_013210	CAT	2	6	173618	173623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513075
2582	NC_013210	GA	3	6	173716	173721	50 %	0 %	50 %	0 %	258513075
2583	NC_013210	AGC	2	6	173734	173739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513075
2584	NC_013210	CTC	2	6	173740	173745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513075
2585	NC_013210	TGATC	2	10	173785	173794	20 %	40 %	20 %	20 %	258513075
2586	NC_013210	TGA	2	6	173847	173852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513075
2587	NC_013210	CCA	2	6	173890	173895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513075
2588	NC_013210	TTC	2	6	173924	173929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513075
2589	NC_013210	TCA	2	6	173938	173943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513075
2590	NC_013210	GC	3	6	173951	173956	0 %	0 %	50 %	50 %	258513075
2591	NC_013210	CCA	2	6	174013	174018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513075
2592	NC_013210	ACG	2	6	174171	174176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513075
2593	NC_013210	CCA	2	6	174205	174210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513075
2594	NC_013210	ATG	2	6	174231	174236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513075
2595	NC_013210	CGC	2	6	174265	174270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513075
2596	NC_013210	GCTG	2	8	174282	174289	0 %	25 %	50 %	25 %	258513075
2597	NC_013210	CGG	2	6	174358	174363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513075
2598	NC_013210	GCA	2	6	174438	174443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513075
2599	NC_013210	AG	3	6	174490	174495	50 %	0 %	50 %	0 %	258513076
2600	NC_013210	ACG	2	6	174524	174529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513076
2601	NC_013210	AGG	2	6	174534	174539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258513076
2602	NC_013210	GGCA	2	8	174631	174638	25 %	0 %	50 %	25 %	258513076
2603	NC_013210	GCC	2	6	174647	174652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513076
2604	NC_013210	AAT	2	6	174659	174664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258513076
2605	NC_013210	TTG	2	6	174678	174683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258513076
2606	NC_013210	TCA	2	6	174708	174713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513076
2607	NC_013210	CAG	2	6	174764	174769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513076
2608	NC_013210	TAA	2	6	174862	174867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258513076
2609	NC_013210	GAA	2	6	175349	175354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513077
2610	NC_013210	ACACC	2	10	175358	175367	40 %	0 %	0 %	60 %	258513077
2611	NC_013210	TTC	2	6	175377	175382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513077
2612	NC_013210	TGC	2	6	175389	175394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513077
2613	NC_013210	GC	5	10	175419	175428	0 %	0 %	50 %	50 %	258513077
2614	NC_013210	TGG	2	6	175431	175436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513077
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2618	NC_013210	GC	3	6	175679	175684	0 %	0 %	50 %	50 %	258513077
2619	NC_013210	CATC	2	8	175862	175869	25 %	25 %	0 %	50 %	258513077
2620	NC_013210	ATG	2	6	175905	175910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513077
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2622	NC_013210	TGG	2	6	175979	175984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513077
2623	NC_013210	AGTAG	2	10	175991	176000	40 %	20 %	40 %	0 %	258513077
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2626	NC_013210	CAT	2	6	176043	176048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513077
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2739	NC_013210	TGTCC	2	10	183987	183996	0 %	40 %	20 %	40 %	258513083
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2742	NC_013210	CGGG	2	8	184289	184296	0 %	0 %	75 %	25 %	258513084
2743	NC_013210	AG	4	8	184302	184309	50 %	0 %	50 %	0 %	258513084
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.